信帆生物：蛋白序列分析软件包

蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 4.3是位于法国的蛋白质生物与化学研究院（Institute of Biology and Chemistry of Proteins）用十多年时间开发出的蛋白质研究软件包。软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容，功能非常强大。应用此软件包，使用个人电脑， 便能进行各种蛋白序列分析与特性预测。感谢软件的编写者，他们将此软件包免费提供给此领域的同行使用，这对于我国的科学技术人员来说，实在是一件好事。因 为一个功能再多再好的专业应用软件，如果作为商业软件进行销售的话，往往使大多数需要使用此软件的科技人员因为科研经费的问题，无缘使用，这点在我国尤为 突出。
软件分为三个版本，分别用于Unix系统，DOS系统与WINDOWS95或98系统，让我以用于WINDOWS系统的版本为例，介绍一下这个软件的基本用法。
软件包为一个自解压执行文件，文件名Anthe4_3c.exe，大小为1.9兆。执行此文件，输入解压后存放的目录名，便可将所有文件解压在此目录下。主程序名为Anthewin，在桌面上建立它的快捷图标，双击快捷图标便打开了ANTHEPROT 4.3主窗口。
通过主程序，我们可以载入蛋白序列，对序列进行编辑、打印、拷贝、改变设定等操作，更重要的是，我们可以在此调用各种所需的分析工具，对蛋白序列进行分析。
一． 序列编辑功能
    ANTHEPROT 4.3的主窗口便是其序列编辑窗口：
    可以使用按键或菜单中的File/Open命令打开各种序列文件，程序识别的文件类型包括：
单序列文件格式：*.SEQ，（ANTHEPROT 3.3支持以下格式的单序列文件：DNA/Strider 格式、EMBL格式、NBRF格式、Pearson/Fasta格式、PIR 格式与IG/Stanford格式);
    含有多个蛋白序列的蛋白数据库文件：*.BAS，(以Pearson/Fasta格式添加序列，上限为30条序列或32K文件大小);
    ClustalV 或ClustalW 文件：*.ALN 含有ClustalW格式的多队列；
含有多队列的Multalin 4.1格式文件：*.MUL；
在Prosite 蛋白数据库中查寻出Site结果的文件：*.SIT，
蛋白质原子空间结构的PDB格式文件：*.PDB；
使用IBCP（服务器预测蛋白二级结构所获得的结果文件格式：*.CNS；

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