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DNA甲基化分析的完整解决方案

点击次数:3163     更新时间:2015-11-29

Zymo于1994年成立于美国加州Orange County,主要研发和生物试剂表观遗传学系列产品和常用分子生物学试剂盒,其DNA甲基化,羟甲基化,核酸提取等产品已得到世界各*实验室的认可,产品具有“快速、简便、超纯”的特点;
Zymo甲基化产品线已被上千次引用在各大主流学术刊物上,包括NATURE、SCIENCE 、PNAS、Stem Cells、 NucleicAcids Res等;迄今,EZ DNAMethylation™系列产品作为DNA重亚硫酸盐处理(DNA甲基化分析前处理)的的金标准,已成为zui和引用次数zui多的产品;


zui受好评的重亚硫酸盐转化试剂盒


产品 1 - EZ DNA Methylation™ Kits(转化率>99%)

  • 该试剂盒已被Illumina, Sequenom, Nimblegen,Agilent,Roche等公司整合入其标准化工作流程中
品名规格货号
EZ DNA Methylation™ Kit (柱子)Column, 50 Rxns, 200 RxnsD5001, D5002
EZ-96 DNA Methylation™ Kit (96孔板高通量)Shallow-Well, 2 x 96 Rxns
Deep-Well, 2 x 96 Rxns
D5003, D5004
EZ-96 DNA Methylation MagPrep (高通量磁珠法)4x96 rxns, 8x96 rxnsD5040, D5041


产品 2 - EZ DNA Methylation™-Gold Kits(转化率>99%)

  • 该试剂盒是目前的重亚硫酸盐转化试剂盒,小于3小时转化时间
品名规格货号
EZ DNA Methylation-Gold™ Kit (柱子)50 Rxns, 200 RxnsD5005, D5006
EZ-96 DNA Methylation-Gold™ Kit (96孔板高通量)Shallow-Well, 2 x 96 Rxns
Deep-Well, 2 x 96 Rxns
D5007, D5008
EZ-96 DNA Methylation-Gold MagPrep (高通量磁珠法)4x96 rxns, 8x96 rxns.D5042, D5043

 
产品 3 - EZ DNA Methylation™-Direct Kits(转化率>99.5%)

  • 该试剂盒可直接以细胞(≥10个细胞),血液和组织(FFPE)作为起始模板,并适合低样本起始量(10个细胞 或 50pgDNA)
品名规格货号
EZ DNA Methlyation-Direct™ Kit (柱子)50 Rxns, 200 RxnsD5020, D5021
EZ-96 DNA Methlyation-Direct™ Kit (96孔板高通量)Shallow-Well, 2 x 96 Rxns
Deep-Well, 2 x 96 Rxns
D5022, D5023
EZ-96 DNA Methylation-Direct MagPrep (高通量磁珠法)4x96 rxns, 8x96 rxns.D5044, D5045


产品 4 - EZ DNA Methylation™-Lightning Kits (转化率>99.5%)

  • 该试剂盒可达zui快的1小时处理时间,*完成DNA的转化
品名规格货号
EZ DNA Methlyation-Lightning Kit(柱子)50 Rxns, 200 RxnsD5030, D5031
EZ-96 DNA Methylation-Lightning Kit(96孔板高通量)Shallow-Well, 2 x 96 Rxns
Deep-Well, 2 x 96 Rxns
D5032, D5033
EZ-96 DNA Methylation-Lightning MagPrep(高通量磁珠法)4x96 rxns, 8x96 rxns.D5046, D5047

 

图注:经重亚硫酸盐处理后的DNA测序表明:位点5的甲基胞嘧啶保持不变,而未甲基化的胞嘧啶(如:位点7,9,11,14和15)在重亚硫酸盐处理后被*转化为尿嘧啶,并在PCR扩增后以胸腺嘧啶被检测到。

产品 5 - EZ RNA Methylation Kit(转化率>99%)

品名规格货号
EZ RNA Methylation Kit50 prep, 200 prepR5001, R5002
  • 该产品为商品化的RNA重亚硫酸盐转化试剂盒
  • 配套Zymo Direct-zol™ RNA MiniPrep (Cat.No. R2050, R2052) 使用,效果杠杠的!
  • 转化得到的RNA可用于RT-PCR, sequencing, library preparation and Next-Gen sequencing等

 

 DNA 标准品 定量 DNA 甲基化程度

Universal Methylated DNA Standards

  • 使用甲基化和未甲基化DNA对照,测定重亚硫酸盐转化效率
  • 与Zymo所有重亚硫酸盐转化产品兼容
品名规格货号
Human Methylated & Non-Methylated DNA Set1 SetD5014
Human WGA Methylated & Non-Methylated DNA Set1 SetD5013
Universal Methylated Human DNA Standard20rxnsD5011
Universal Methylated Mouse DNA Standard20rxnsD5012

图注:使用M.Sssl  甲基化酶测定的*甲基化。
来源于HCT116 DKO细胞的非甲基化和甲基化的DNA经Mspl 和 Hpall 限制性内切酶消化处理。Mspl可消化非甲基化和甲基化的DNA,而Hpall只能消化非甲基化DNA,无法消化CpG的甲基化。
 
5-mC & 5-hmC ELISA Kits - 灵敏的 5-mC  5-hmC 定量

  • 适用于基因组DNA中5-mC和5-hmC的高通量全局检测
  • 整个工作流程zui快可在3小时内完成
品名规格货号
5-mC DNA ELISA Kit1 x 96 Preps
2 x 96 Preps
D5325
D5326
Quest 5-hmC™ DNA ELISA Kit1 x 96 Preps
2 x 96 Preps
D5425
D5426

图注:5-mC DNA ELISA Kit可定量检测来自于众多样本来源DNA中 5-mC程度(%),其结果与LC-MS检测样本结果密切关联。
 

其他甲基化研究相关试剂

品名规格货号
Anti-5-Methlycytosine Monoclonal Antibody 15 ul, 30 ul, 50 ul, 200 ul@ 1 ug/ul A3001-15,A3001-30,A3001-50,A3001-200
Anti-5 hmC Polyclonal Antibody25ug/25ul, 50ug/50ul, 200ug/200ulA4001-25, A4001-50, A4001-200
Methylated – DNA IP Kit10 RxnsD5101
OneStep qMethyl™ Kit44 testsD5310
OneStep qMethyl™ - Lite44testsD5311
Quest 5-hmC Detection Kit (includes Mspl GSRE)25 preps, 50 prepsD5410, D5411
Quest 5-hmC Detection-Lite Kit (GSRE not included)25 preps, 50 prepsD5415, D5416
Quest 5-hmC DNA Enrichment Kit25 rxns. 50 rxns.D5420, D5421
CpG Methylase (M.Sssl)200U, 400UE2010, E2011
CpG Methylase (M.CviPI)200U, 1000UE2014, E2015
5-hmC Glucosyltransferase100 units, 200 unitsE2026, E2027
ZymoTaq DNA Polymerase50 rxns. 200rxnsE2001, E2002
ZymoTaq PreMix50 rxns. 200rxnsE2003, E2004


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常见问题解答: 
Q:在用Zymo的重亚硫酸盐试剂盒处理前,起始DNA样本应该储存在TE,水,还是其他缓冲液中?
A:水和TE缓冲液均可用来储存DNA,并且不会对转化过程造成干扰。
 
Q: 为什么使用EZ DNA Methylation-Direct Kit,我的DNA没有得到*的转化?
A: 1) 如果是固体样本,很可能是处理的样本量过大,而导致不*DNA转化;
  2)如果是FFPE组织样本,有可能是DNA已大规模受损以及/或者交联,导致不*转化;
  3)如果在Proteinase K消化后,没有通过离心去除碎片,则可能会干扰重亚硫酸盐转化过程,导致DNA的不*转化;
 
Q:  为什么EZ-96 DNA Methylatioin 甲基化(96孔板)产品线有两种不同的目录号?
A:   这两种不同的目录号是用来区分试剂盒内不同类型的96孔板。深孔板和浅孔板均适用于大多数离心机和微板架。如下阐释了这两类96孔板的区别:

 Silicon-AZymo-Spin I-96
款式浅孔深孔
尺寸(H x W x L)19 mm x 83 mm x 125 mm35 mm x 83 mm x 125 mm
结合/收集板组合高度43 mm60 mm
结合力/zui小洗脱体积5µg/30µl per well5µg/15µl per well
货号D5003, D5007, D5022, D5032D5004,D5008, D5023, D5033


Q: Zymo 重亚硫酸盐处理试剂盒与illumina技术平台兼容吗? 
A:  是的,Zymo的EZ DNA Methylation Kit技术被illumina使用在其GoldenGate和Infinium Assays平台上;
 
Q: 用Zymo的EZ DNA Methylation Kit转化得到的DNA可用作哪些下游分析应用?
A:  用Zymo的任何一款EZ DNA Methylation kit转化得到的DNA,可适用于后续的各类测序分析法,Ms-SNuPE, COBRA,  Bisulfite-PCR, MSP, Bisulfite-sequencing, mass spectroscopy (如: Sequenom的EpiTYPER), 以及其他分析方法。

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